Đặc điểm di truyền Avian Nephritis virus (ANV) gây bệnh viêm thận trên gà qua phân tích gene ORF1b

Abstract

“Đặc điểm di truyền Avian Nephritis virus (ANV) gây bệnh viêm thận trên gà qua phân tích gene ORF1b” được thực hiện nhằm xác định sự hiện diện và phân tích đặc điểm di truyền của virus gây bệnh viêm thận trên gà tại một số tỉnh đồng bằng sông Cửu Long. Qua kiểm tra 310 mẫu gà có triệu chứng ủ rũ, giảm ăn, mất nước, xù lông và tiêu chảy bằng kỹ thuật realtime RT-PCR ghi nhận 65 mẫu dương tính với ANV chiếm tỉ lệ 20,97%. Kết quả phân tích cây phát sinh loài trình tự nucleotide và amino acid đoạn ORF1b cho thấy 3 chủng ANV-ORF1b-CTU1, ANV-ORF1b-CTU2 và ANV-ORF1b-CTU3 có mối quan hệ gần về mặt di truyền. Qua phân tích tỷ lệ tương đồng nucleotide và amino acid giữa 3 chủng phân lập và 11 chủng tham chiếu có tỉ lệ cao. Tỉ lệ tương đồng nucleotide và amino acid của 3 chủng phân lập lần lượt là 92,4%-94,57%, 93,95%-96,28%. Tỉ lệ tương đồng của 14 chủng về nucleotide lớn hơn 84% còn amino acid là lớn hơn 89%. Phân tích trình tự amino acid của 3 chủng phân lập chứng tỏ đoạn ORF1b là đoạn bảo tồn; chỉ xuất hiện đột biến thay thế ở một số vị trí với số lượng ít.