Sự biến đổi cấu trúc hệ vi khuẩn trong đường ruột tôm thẻ chân trắng Litopenaeus vannamei khi cho ăn bổ sung hỗn hợp synbiotic bằng kỹ thuật giải trình tự thế hệ mới (NGS)

Abstract

Mục tiêu của nghiên cứu này là làm sáng tỏ cấu trúc quần thể vi khuẩn trong đường ruột của tôm Litopenaeus vannamei sau khi được cho thức ăn cơ bản (đối chứng) và thức ăn bổ sung synbiotic (Lactobacillus plantarum CM8.1 108 CFU/kg và 0,2% chất chiết prebiotic từ chuối) trong 30 ngày bằng công nghệ giải trình tự thế hệ mới để xem liệu những thay đổi trong hệ vi sinh vật đường ruột có liên quan đến hiệu suất tăng trưởng và tình trạng sức khỏe được cải thiện của tôm hay không. Dữ liệu giải trình tự thế hệ mới cho thấy đã phát hiện tổng cộng 623 OTUs và phân thành 15 ngành, 18 lớp, 54 bộ, 82 họ và 130 giống trong ống tiêu hóa của tôm. Kết quả phân tích dữ liệu cho thấy, cả hai nhóm nghiệm thức giống nhau 100 giống với 10 giống đặc trưng ở nhóm tôm đối chứng và 19 giống đặc trưng ở nhóm nghiệm thức synbiotic. Tôm được cho ăn chế độ có bổ sung synbiotic cho thấy sự cải thiện các loài lợi khuẩn acid lactic như Lactobacillus, Enterobacter, nhóm trực khuẩn Bacillus và giảm tỷ lệ Vibrio trong đường ruột của tôm. Điều này cho thấy synbiotic có khả năng kiểm soát và thay đổi hệ vi sinh đường ruột của tôm và có thể được sử dụng kiểm soát bệnh do hại khuẩn Vibrio gây ra trên tôm, góp phần nâng cao năng suất tôm thẻ chân trắng trong các mô hình nuôi.