Khảo sát đặc điểm gene VP1 virus gây bệnh lở mồm long móng trên bò tại tỉnh Sóc Trăng

Abstract

Đề tài “Khảo sát đặc điểm gene VP1 virus gây bệnh lở mồm long móng trên bò tại tỉnh Sóc Trăng” được thực hiện từ tháng 9 đến tháng 12 năm 2025 nhằm xác định đặc điểm gene VP1 của virus gây bệnh lở mồm long móng (LMLM) lưu hành trên đàn bò tại huyện Mỹ Xuyên, tỉnh Sóc Trăng. Kết quả phân tích bằng kỹ thuật RT-PCR cho thấy trong 72 bò có biểu hiện bệnh, 14 bò dương tính với virus LMLM, chiếm tỷ lệ 16%. Kết quả phân tích phả hệ di truyền và so sánh độ tương đồng giữa các chủng Nhu 1, Nhu 2 và Nhu 3 tại tỉnh Sóc Trăng cho thấy chủng Nhu 1 thuộc dòng Ind-2001e, chủng Nhu 2 và Nhu 3 cùng thuộc dòng PanAsia (cả 3 chủng nghiên cứu đều thuộc topotype ME-SA, serotype O). Độ tương đồng của chủng Nhu 1 với chủng O/VIT/8338/2017 (MH891503.1) thuộc dòng Ind-2001e là 98,73% nucleotide và 98,07% amino acid, chủng Nhu 2 và Nhu 3 có độ tương đồng với chủng O/VIT/366/2012 (KT153144.1) thuộc dòng PanAsia là 96,82-96,97% nucleotide và 97,1% amino acid. Kết quả so sánh trình tự amino acid VP1 giữa các chủng phát hiện hiện được với các chủng tham chiếu cho thấy 40 vị trí biến đổi (chiếm tỷ lệ 18,96%), đặc biệt tập trung nhiều sự đột biến trên đoạn gene 133 đến 158. Kết quả so sánh trình tự amino acid VP1 giữa các chủng phát hiện được với chủng vaccine nhận thấy rằng có 22 vị trí (chiếm tỷ lệ 10,43%) amino acid tại đoạn gene 133 đến 158 và 197 đến 205