Khảo sát sự lưu hành và đặc điểm di truyền của Novel Duck Reovirus tại Cai Lậy, tỉnh Tiền Giang

Abstract

Nghiên cứu được thực hiện nhằm xác định sự hiện diện và đặc điểm di truyền của NDRV đang lưu hành tại Cai Lậy, tỉnh Tiền Giang. Kết quả chẩn đoán RT-PCR cho thấy tỷ lệ nhiễm NDRV theo đàn là 17,14% và theo mẫu là 10,26%. Kết quả phân tích thống kê cho thấy tỷ lệ nhiễm NDRV phụ thuộc vào tuổi (P<0,05), tuy nhiên không phụ thuộc vào giống (P>0,05). Phân tích phả hệ di truyền và mức độ tương đồng nucleotide và amino acid cho thấy 2 chủng được phân lập từ đàn vịt ở Tiền Giang là DRO-CL-TG1, DRO-CL-TG2 nằm chung nhánh và có tỷ lệ tương đồng nucleotide và amino acid cao nhất với chủng MH510251.1/ SH12 ở Trung Quốc từ 98,44 đến 98,76%. Bên cạnh đó, DRO-CL-TG3 lại nằm chung nhánh và có tỷ lệ tương đồng trình tự nucleotide và amino aicid cao nhất với chủng KF154116.1/ ZJ00M ở Trung Quốc từ 97,72% đến 97,82%. Qua đó, cho thấy ba chủng lưu hành tại Cai Lậy, tỉnh Tiền Giang DRO-CL-TG1, DRO-CL-TG2 và DRO-CL-TG3 đều thuộc nhóm NDRV. Kết quả phân tích trình tự amino acid giữa các chủng tham chiếu chỉ xuất hiện đột biến thay thế