Khảo sát và phân tích đặc điểm di truyền của Porcine circovirus type 2 trên đàn heo tại thành phố Hồ Chí Minh và thành phố Đồng Nai

Abstract

Đề tài “Khảo sát và phân tích đặc điểm di truyền của Porcine circovirus type 2 (PCV2) trên đàn heo nuôi tại Thành phố Hồ Chí Minh và Thành phố Đồng Nai” được thực hiện nhằm xác định sự hiện diện, đặc điểm lâm sàng và phân tích đặc điểm di truyền của PCV2 trên đàn heo tại hai địa phương nghiên cứu. Nghiên cứu khảo sát khoảng 200 cá thể heo tại các cơ sở chăn nuôi, trong đó thu thập 100 mẫu (50%) từ các cá thể có biểu hiện lâm sàng nghi nhiễm PCV2 để thực hiện phản ứng PCR và giải trình tự một số chủng đại diện. Kết quả ghi nhận triệu chứng còi cọc, lông khô và xơ xuất hiện ở 100% số heo được chọn mẫu; ngoài ra còn quan sát thấy các biểu hiện rối loạn hô hấp, tiêu chảy và viêm da với các mức độ khác nhau. Kết quả PCR cho thấy 55/100 mẫu (55,0%) dương tính với PCV2. Từ các mẫu dương tính, nghiên cứu đã khuếch đại và giải trình tự toàn bộ bộ gen của bốn chủng PCV2 đại diện, gồm hai chủng tại Thành phố Hồ Chí Minh và hai chủng tại Thành phố Đồng Nai. Phân tích phát sinh loài dựa trên trình tự bộ gen cho thấy cả bốn chủng đều thuộc kiểu gen PCV2d. So sánh trình tự acid amin của protein Capsid (Cap) ghi nhận các thay đổi D134N, G169R và N232K, cùng 12 vị trí acid amin khác biệt so với chủng vắc-xin; trong đó một số đột biến như A68N, F53I và S169G/R đã được báo cáo có thể liên quan đến khả năng gắn thụ thể, đặc tính kháng nguyên của virus dẫn đến ảnh hưởng hiệu quả bảo hộ của vắc-xin