THIẾT KẾ MỒI CHUYÊN BIỆT NHẬN DIỆN VI KHUẨN Bacillus amyloliquefaciens

Abstract

Bacillus amyloliquefaciens thuộc nhóm Bacillus subtilis là một nhóm gồm ít nhất 9 loài vi khuẩn có đặc điểm kiểu hình và có tính tương đồng đoạn gen 16S rRNA cao. Phương pháp định danh truyền thống các loài vi khuẩn thuộc nhóm này tương đối khó khăn và tốn nhiều thời gian. Trên cơ sở đó, nghiên cứu này được thực hiện với mục tiêu thiết kế cặp mồi chuyên biệt cho dòng vi khuẩn Bacillus amyloliquefaciens dựa trên trình tự vùng BARD7_00361, nhằm mục đích phát hiện nhanh dòng vi khuẩn này bằng kỹ thuật PCR. Kết quả cho thấy, cặp mồi AmyF (5’-GAATACCGTCCTCTGTCTG- 3’) và AmyR (5’-CATCTGCCTGGCTCCGTTTT-3’) được thiết kế là đặc hiệu với vi khuẩn Bacillus amyloliquefaciens với sản phẩm khuếch đại là 423bp cùng với chu trình nhiệt thích hợp. Từ khóa: Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus subtilis, 16S rRNA, BARD7_00361, Mồi chuyên biệt.