Đánh giá đa dạng trình tự DNA mã vạch và dấu phân tử ISSR trên bưởi da xanh ở khu vực đồng bằng sông Cửu Long.

Abstract

10. Bưởi da xanh ở các tỉnh đồng bằng sông Cửu Long được khảo sát trình tự DNA mã vạch với 3 vùng trình tự ITS, ycf1b, psbK-psbI kết hợp với phân tích đa dạng di truyền bằng dấu phân tử ISSR. DNA được ly trích theo quy trình CTAB và khuếch đại vùng trình tự ITS, ycf1b, psbK-I với kích thước lần lượt là 620bp, 880bp, 430bp, kết hợp với khuếch đại 2 dấu phân tử là ISSRK2 và ISSR22. Đối với các vùng trình tự sau khi khuếch đại thành công được tiến hành giải trình tự bằng hệ thống tự động ABI 3130 và được phân tích bằng phần mềm chuyên dụng Bioedit để so sánh bưởi da xanh với các 4 giống bưởi khác trên cơ sở so sánh cục bộ và đối chiếu với các trình tự trên ngân hàng gen. Kết quả khảo sát các vùng trình tự cho thấy các giống bưởi trong nghiên cứu tương đối đồng nhất với nhau về mặt di truyền qua phân tích các vùng trình tự ITS, ycf1b, psbK-I. Dấu phân tử ISSRK2 và ISSR22 kết quả PCR đã khuếch đại được 19 băng DNA trong đó có 11 băng đa hình chiếm 57,89% và 8 băng đơn hình chiếm 42,11%, kết quả phân tích bằng phần mềm NTSYSpc 2.11 theo phương pháp UPGMA cho thấy mức độ tương đồng có 9 mẫu bưởi dựa trên dấu phân tử ISSR nằm trong khoảng 0,53-0,95. Dựa vào giản đồ phả hệ có thể chia 9 mẫu bưởi thành 3 nhóm lớn. Nhóm thứ nhất chỉ có mẫu BDTG, nhóm thứ 2 có 6 mẫu với độ tương đồng di truyền nằm trong khoảng 0,85-0,95, nhóm cuối cùng gồm mẫu với hệ số tương đồng là 0,74. Kết quả trên cho thấy các vùng trình tự được khảo sát có tính bảo tồn cao, ít biến động về mặt di truyền.