Giải trình tự và phân tích toàn bộ hệ gen chủng Virus nhược độc Hanvet1.VN sử dụng trong sản xuất Vaccine phòng hội chứng rối loạn sinh sản và hô hấp ở lợn

Abstract

Chủng virus gây hội chứng rối loạn sinh sản và hô hấp ở lợn (PRRSV) nhược độc Hanvetl.VN đã được phát triển bởi Công ty cổ phần dược và vật tư thú y (Hanvet) bằng phương pháp cấy truyền chủng HY-2010 trên tế bào Marc-145 sau 80 đời và đang sử dụng để sản xuất vaccine PRRS. Trong nghiên cứu này, chúng tôi đã giải mã và phân tích toàn bộ hệ gen chủng PRRSV Hanvetl.VN. RNA tổng số được tách chiết từ chủng Hanvetl.VN, sử dụng RT-PCR khuếch đại 15 phân đoạn riêng rẽ của toàn bộ hệ gen. Các đoạn gen sau khi khuếch đại được nhân dòng vào vector pCR2.1 và xác định trình tự bằng phương pháp Sanger. Trình tự gen được phân tích bằng chương trình phần mềm BioEdit và DNA Star. Kết quả cho thấy, chủng Hanvetl.VN có protein GP5 tương đồng về trình tự amino acid là 100% so với chủng cường độc phân lập ở Quảng Nam (07QN) và 98% so với một chủng Trung Quốc (07NM). Tuy nhiên, protein GP5 này có độ tương đồng khá thấp so với chủng VR2332 chỉ đạt 87%. Các protein MP và NP có tính bảo thủ cao so với các chủng cưỡng độc lưu hành ở Việt Nam và Trung Quốc, đều đạt 99-100%. Các protein còn lại đều có sự thay đổi so với chủng cường độc 07QN, dao động từ 1,2% ở NPla đến 3,9% ở GP2. Tuy nhiên, sự tương đồng về trình tự amino acid của tất cả các protein chủng Hanvetl.VN nhược độc đều rất thấp nếu so sánh với chủng chuẩn PRRSV type II (chủng Bắc Mỹ VR2332), dao động từ 86,25% đến 97,7%. Kết quả nghiên cứu của chúng tôi cho thấy, chủng vaccine Hanvetl.VN nhược độc có đặc tính kháng nguyên sinh miễn dịch phòng hộ tương đồng cao so với chủng PRRSV lưu hành trong nước, gần gũi so với chủng lưu hành ở Trung Quốc nhưng có sự khốc biệt khá xa so vợi chủng cổ điển type II Bắc Mỹ (VR2332). Vì vậy khi nhập vaccine, đặc biệt từ các nước Âu-Mỹ để dự phòng bệnh PRRS cũng nên xem xét cả nguồn gốc chủng PRRSV sử dụng trong sản xuất vaccine.