KHẢO SÁT TƯƠNG TÁC CỦA MỘT SỐ HỢP CHẤT FLAVAN-3-OL VÀ FLAVANONE ỨC CHẾ PROTEIN NEURAMINIDASE ĐỘT BIẾN BẰNG MÔ HÌNH DOCKING PHÂN TỬ.

Abstract

Thực nghiệm tiến hành tải về các hợp chất khung Flavan-3-ol (53 chất) và Flavanone (889 chất) có sẵn trên https://coconut.naturalproducts.net, cùng với đối chứng dương là Oseltamivir và Laninamivir. Sau đó tách riêng biệt các chất và tối ưu hóa chúng, đồng thời chuyển đổi tệp cho phù hợp với phần mềm PyRx. Kế tiếp, docking lần 1 với protein 3CL0 và khung hộp lưới rộng bao gồm 53 chất thuộc khung Flavan-3-ol, 889 chất thuộc khung Flavanone, Laninamivir, Oseltamivir. Qua đó thu được 15 chất thuộc Flavan-3-ol và 159 chất thuộc Flavanone phù hợp. Tiếp tục thực hiện docking lần 2 với khung hợp lưới hẹp với các chất đã chọn lọc ra ở lần docking thứ nhất và sàng lọc lần 2 các chất còn lại phù hợp nhất để phân tích và trình bày nó trên phần mềm biểu diễn.