Vui lòng dùng định danh này để trích dẫn hoặc liên kết đến tài liệu này: https://dspace.ctu.edu.vn/jspui/handle/123456789/81698
Nhan đề: Modeling amino acid substitutions for whole genomes
Tác giả: Le, Sy Vinh
Từ khoá: Evolutionary analysis
Amino acid substitution models
Protein analysis
Genome analysis
Maximum likelihood estimation
Năm xuất bản: 2021
Tùng thư/Số báo cáo: Journal of Computer Science and Cybernetics;Vol.37, No.04 .- P.351–363
Tóm tắt: Modeling amino acid substitution process is a core task in bioinformatics. New advanced sequencing technologies have generated huge datasets including whole genomes from various species. Estimating amino acid substitution models from whole genome datasets provides us unprecedented opportunities to accurately investigate relationships among species. In this paper, we review state-of-the-art computational methods to estimate amino acid substitution models from large datasets. We also describe a comprehensive pipeline to practically estimate amino acid models from whole genome datasets. Finally, we apply amino acid substitution models to build phylogenomic trees from bird and plant genome datasets. We compare our newly reconstructed phylogenomic trees and published ones and discuss new findings.
Định danh: https://dspace.ctu.edu.vn/jspui/handle/123456789/81698
ISSN: 1813-9663
Bộ sưu tập: Tin học và Điều khiển học (Journal of Computer Science and Cybernetics)

Các tập tin trong tài liệu này:
Tập tin Mô tả Kích thước Định dạng  
_file_
  Giới hạn truy cập
2.69 MBAdobe PDF
Your IP: 3.137.170.38


Khi sử dụng các tài liệu trong Thư viện số phải tuân thủ Luật bản quyền.