Vui lòng dùng định danh này để trích dẫn hoặc liên kết đến tài liệu này:
https://dspace.ctu.edu.vn/jspui/handle/123456789/947
Nhan đề: | Giải thuật sửa lỗi cho các trình tự ADN ngắn = |
Nhan đề khác: | Algorithm of short-read error correction |
Tác giả: | Nguyễn, Văn Hòa Nguyễn, Văn Đông |
Từ khoá: | Chuỗi ADN Xác lập trình tự ADN Chuỗi ADN ngắn Chỉ mục Sửa lỗi |
Năm xuất bản: | 2013 |
Tùng thư/Số báo cáo: | Tạp chí Khoa học Trường Đại học Cần Thơ;Số chuyên đề Công nghệ thông tin .- Tr.20-27 |
Tóm tắt: | Ngày nay với sự tiến bộ của kỹ thuật xác lập trình tự ADN (DNA Sequencing) chúng ta có thể tạo ra một số lượng lớn các chuỗi ADN trong khoảng thời gian ngắn với chi phí thấp. Đặc biệt thế hệ xác lập trình tự mới hiện nay tạo ra số lượng rất lớn chuỗi ADN ngắn, được gọi là short read, với chiều dài từ 30 đến 100 nulcotide. Các read này có tỉ lệ lỗi từ 1% đến 2%. Do đó các read lỗi này phải được sửa lỗi trước khi được lắp ráp thành bộ gen ADN hoàn chỉnh. Nhiều giải thuật sửa lỗi đã được đề xuất như SHREC, SOAP de Novo. Nhưng những giải thuật này vẫn còn những hạn chế như cần dung lượng bộ nhớ lớn hoặc thời gian sửa lỗi khá nhiều. Trong bài báo này chúng tôi đề xuất giải thuật hiệu chỉnh lỗi, được đặt tên là RCorrector, dựa trên cấu trúc chỉ mục kmer nhằm phát hiện lỗi và sửa lỗi trực tiếp trên các read. So sánh với giải thuật SHREC trên 8 tập dữ liệu, RCorrector đạt được hiệu suất sửa lỗi thông qua hai đặc trưng specificity và sensitivity là tương đương với SHREC nhưng nhanh hơn SHREC từ 3 đến 7 lần. |
Định danh: | http://172.18.63.105/jspui/handle/123456789/947 |
ISSN: | 1859-2333 |
Bộ sưu tập: | Năm 2017 |
Các tập tin trong tài liệu này:
Tập tin | Mô tả | Kích thước | Định dạng | |
---|---|---|---|---|
_file_ | 647.19 kB | Adobe PDF | Xem | |
Your IP: 3.15.225.164 |
Khi sử dụng các tài liệu trong Thư viện số phải tuân thủ Luật bản quyền.