Phân tích dữ liệu ngân hàng gene và xác định sự phân bố của virus gây bệnh dịch tả heo Châu Phi trên thế giới

Abstract

Đề tài được thực hiện nhằm thống kê và xác định tổng số lượng đăng ký trình tự gene của ASFV trên Ngân hàng Gene sau đó phân tích và mô tả theo khu vực địa lý và vật chủ trong giai đoạn từ năm 1992 đến năm 2023. Nghiên cứu tiến hành bằng việc truy xuất dữ liệu từ Ngân hàng Gene (Genebank). Với tổng số dữ liệu truy xuất được 12.225 trình tự. Tiến hành xử lý số liệu bằng phần mềm Microsoft Excel 2010 và ngôn ngữ lập trình R. Kết quả của đề tài cho thấy tổng cộng 12.225 trình tự ASFV từ nhiều quốc gia, với 10.038 trình tự sau khi xử lý dữ liệu. Châu u có số lượng đăng ký cao nhất (4.473 trình tự. Giai đoạn 2018-2023 chiếm hơn 70% tổng số trình tự, với Việt Nam nổi bật với 1.605 trình tự và Châu Phi ghi nhận số lượng đáng kể trên ve. Heo nhà chiếm tỷ lệ cao nhất (54%) và heo rừng (35%). Có 69 quốc gia đăng ký trình tự ASFV. Trong đó, Việt Nam là quốc gia có số trình tự đăng ký lớn nhất với 1.065 trình tự. Trình tự ASFV bắt đầu được đăng ký từ năm 1992. Năm 2021 và năm 2023 là hai năm có số trình tự đăng ký nhiều nhất lần lượt là 2.591 và 3.110 trình tự. Qua nghiên cứu này khuyến khích việc mở rộng chiến lược giám sát bộ gene và tăng khả năng giải trình tự gene để cung cấp kiến thức về tiến hóa di truyền cũng như dịch tễ của virus dịch tả heo châu Phi (ASFV).