Khảo sát đặc điểm phân tử Reovirus trên vịt

Abstract

Đề tài “Khảo sát đặc điểm phân tử Reovirus trên vịt” được thực hiện nhằm xác định mối quan hệ di truyền ở các chủng Reovirus lưu hành phổ biến đã được công bố trên NCBI dựa trên trình tự nucleotide của các đoạn S1, S2, S3 và S4. Đề tài thực hiện từ tháng 9 năm 2023 đến tháng 12 năm 2023. Qua phân tích phả hệ di truyền và so sánh độ tương đồng trình tự nucleotide các đoạn gene vùng S của 3 nhóm (MDRV, NDRV và ARV) bằng phương pháp so sánh cặp với mô hình tối ưu (Bootstrap x1000), cho thấy các chủng cùng nhóm có tỷ lệ tương đồng cao, S1 (93,88 – 99,81%); S2 (94,78 – 99,60%); S3 (97,12 - 99,66%) và S4 (81,34 - 99,27%). Ngược lại, các chủng khác nhóm có tỷ lệ tương đồng thấp dao động 39,10 - 87,83%. Kết quả phân tích và so sánh những biến đổi trình tự nucleotide đoạn S1 của 3 nhóm (MDRV, NDRV và ARV) cho thấy đây là vùng có nhiều biến đổi nhất (75,18%). Trong khi đó, đoạn S2, S3, S4 là vùng ít biến đổi hơn với tỉ lệ biến đổi lần lượt là 27,56%; 55,97%; và 19,64%. Do đó, có thể sử dụng vùng S1 trong xác định kiểu gene Reovirus trên gia cầm và ứng dụng vùng S2, S4 trong chẩn chẩn đoán phát hiện ARV và DRV.